Nintendo compartió el tráiler de lanzamiento de Pokémon Crystal en la Consola Virtual de Nintendo 3DS, siendo una adaptación del título original de Game Boy Color, ahora disponible en la consola portátil de la Gran N.
El juego se ha hecho compatible con las funciones de comunicación inalámbrica de la consola, todo esto para realizar intercambios y combates en conexión entre las versiones para la consola virtual; además es compatible con la función Cápsula del Tiempo, que permite intercambiar Pokémon en conexión desde los Centros Pokémon, y también con el Banco de Pokémon.
Finalmente, por primera vez en Occidente los jugadores tendrán acceso al evento que desbloquea a Celebi en el Encinar gracias a un evento después de completar el juego.