• Aquiles con Kyogre
• Magno con Groudon
• Helios con Dialga, Palkia o Giratina
• Ghechis con Reshiram, Kyurem o Zekrom
• Lysson con Xerneas o Yveltal

Los juegos incluyen además la Agencia de Combate, donde nos pondremos en el papel de Agente y luchar contra un gran número de oponentes, además de poder tomar prestados Pokémon para luchar, incluso legendarios como Thundurus pueden ser tomados y usados para alcanzar la victoria en este nuevo modo de combate. Se podrá usar tanto la conexión local como online. Entre más luchemos, más capaces serán los Pokémon que consigamos.

Este nuevo modo ha sido añadido para premiar a los mejores entrenadores con objetos muy exclusivos y raros, algo muy similar al Frente Batalla.

Por otro lado, conocemos los Pokémon legendarios exclusivos de cada versión de los juegos. Empezamos con Pokémon Ultra Sun:

• Ho-oh
• Raikou
• Groudon
• Latios
• Heatran
• Dialga
• Reshiram
• Tornadus
• Xerneas

También tenemos la lista de Pokémon Ultra Moon:

• Lugia
• Entei
• Kyogre
• Latias
• Regigigas
• Palkia
• Zekrom
• Thundurus
• Yveltal

Finalmente, se confirma que el Lector QR volverá a estar disponible en estas nuevas entregas de la saga, con los cuales podremos obtener Pokémon como Charmander, Grovyle y Greninja, todas pertenecientes a distintas regiones.